通州市轄鎮。1957年為新余鄉，1958年更名三余公社，1983年改鄉，1984年鄉鎮合并設三余鎮。位于市境東北部，距市府30公里。面積40.4平方公里，人口3.8萬(wàn)。省道掘青公路與金三公路在境內交會(huì )，團結河與三余豎河交錯。轄菜園、三余、齊樂(lè )、中義、大樂(lè )、斗爭、貢安、光榮、大興、中心、鎮北、紅專(zhuān)、紅星、前進(jìn)、合力、立新、鎮西、士文、新民、鎮東、一社、永興、新南23個(gè)村委會(huì )和鎮北、中心2個(gè)居委會(huì )。農業(yè)以種植糧、棉為主，鰻魚(yú)苗、文蛤為特產(chǎn)。企業(yè)產(chǎn)品有油咀、油泵、高檔皮毛機。.

2021年10月，三余鎮上榜2021年全國千強鎮名單，排名第602位。

2012年12月，環(huán)境保護部授予三余鎮2010—2011年度國家級生態(tài)鄉鎮稱(chēng)號。

大有晉墾區格局

大有晉墾區格局位于通州灣示范區三余鎮向陽(yáng)街（三余鎮糧食管理所內），為南通市文物保護單位。保護范圍：整個(gè)院落。建設控制地帶：周邊為建成民宅或農田，不適宜劃定建設控制地帶。

三門(mén)閘

三門(mén)閘位于通州灣示范區三余鎮恒興至環(huán)本遙望港南側三門(mén)閘河，為南通市文物保護單位。保護范圍：東西向覆蓋整個(gè)橋面。建設控制地帶：周邊為水面或道路，不需要劃定建設控制地帶。